等位基因分型标准物是某- STR遗传标记在人群中常见的等位基因的混合物(Sajanti-la et a1．，1992)。它们和检测样本使用相同的引物，为每一个等位基因提供DNA片段大小参照物。等位基因ladder对精确地基因型分型十分重要(Smith，1995)。这些ladder就像一个量尺，是检测每一个SIR基因座的标准，它是对不同实验室因仪器和条件不同检测到的不同片段进行校正的必要保证。
ladder是由基因组DNA或人群中多个个体的基因座特异性PCR产物联合构建，其中含有特定STR遗传标记的所有等位基因(Sajantila et a1．，1992; BaechtPI et al.;1993)。这些样本一起扩增，产生一个人为样本，其中包含STR遗传标记的常见等位基因。通过调整每种组分的加入量来平衡各等位基因的含量，以保证ladder中各种等位基因的量的平衡。如产生一个五等位基因6 \7.8.9、10次重复的ladder，可联合使用分型为(6/8)、(7/10)、 (9/9)白勺样本。还可以是(6/9)、(7／8)、(10110)或(6/6)、(7/7)、(8/8)、(9／9)、(10110)的组合。 为获得更多的ladder（二代和三代ladder），可以简单地用去离子水稀释原始ladder到l／1 000 000～1／1000后，重新使用相同的PCR引物扩增（Baechtel et al．，1993）。必须使用与扩增未知样本相同的PCR引物合成ladder，保证未知样本与ladder比较时，可精确获得未知样本的重复次数。如下所述，商业试剂公司提供STR分型试剂金的ladder，实验室无需自己制作。