一，个体识别
除同卵双生子外，每个生物个体的DNA分子是不同的，DNA遗传标志终身不变。两种比对检材的核DNA序列不同一，则它们为非同一个体，如果核DNA序列相同，不论检材来自何种组织，被检的两份检材应来自同一个体。DNA测序技术的个人识别能力远高于DNA指纹技术、PCR-STR复合技术。
线粒体DNA的拷贝比核DNA多很多倍，抗降解能力强，陈旧、腐败检材、无核检材，如：毛干、指甲都能提取到线粒体DNA，对于线粒体DNA来说，虽然具有母系遗传特性，但突变率极高，人群间存在差异，同一人群中不同个体间也存在差异。通过对105名汉族无个体的线粒体DNA测序分析，不同个体的碱基突变数是4.029个，最高达到9个。排除绿可达95.6%-98.1%，线粒体DNA具有高度序列多态性，可用于个体识别。
二，父系、母系亲属间的鉴定
Y染色体在父子、祖父孙子之间序列是一致的，在得不到母亲DNA样本时可对可疑父子、祖孙等之间亲属关系进行认定。线粒体DNA呈现母系遗传，兄弟姐妹、表兄弟姐妹、姨的线粒体DNA序列一致，在无法得到父母DNA样本进行鉴定情况下，利用兄弟姐妹等县里体DNA进行鉴别。
